Third round
edit| 30 September 2020 | FC Zbrojovka Brno (1) | 1-0 | FC Vysočina Jihlava (2) | Brno |
Šumbera  87' |
Stadium: Městský fotbalový stadion Srbská |
| 30 September 2020 | TJ Jiskra Domažlice (3) | 1–0 | SK Sigma Olomouc (1) | Olomouc |
| 30 September 2020 | FK Chlumec nad Cidlinou (3) | 1–3 | FK Teplice (1) | Chlumec nad Cidlinou |
|
|
| 30 September 2020 | MFK Chrudim (2) | 1-1 (6-7 p) | FK Mladá Boleslav (1) | Chrudim |
| 11 November 2020 | FC Slavia Karlovy Vary (3) | 0–2 | SFC Opava (1) | Karlovy Vary |
| 30 September 2020 | MFK Karviná (1) | 1-3 | FC Sellier & Bellot Vlašim (2) | Karviná |
| Haša 52' |
Breda 7'
Vrána 48' |
Stadium: Městský stadion |
| 30 September 2020 | SK Líšeň (2) | 1–0 | FK Jablonec (1) | Brno |
| 30 September 2020 | 1. FC Slovácko (1) | 6-0 | 1. FK Prostějov (2) | Uherské Hradiště |
| J. Kliment 19' (pen.), 35' (pen.), 71'
M. Kadlec 82' |
Stadium: Městský fotbalový stadion Miroslava Valenty |
| 30 September 2020 | AC Sparta Prague (1) | 2–0 | FK Blansko (2) | Prague |
| Stadium: Strahov Stadium |
| 30 September 2020 | FC MAS Táborsko (2) | 0-3 | Bohemians 1905 (1) | Tábor |
| Levin 58'
Puškáč 90' |
| 14 November 2020 | FK Fotbal Třinec (2) | 1–2 | FC Baník Ostrava (1) | Třinec |
| Stadium: Stadion Rudolfa Labaje |
| 30 September 2020 | TJ Jiskra Ústí nad Orlicí (3) | 0-3 | SK Dynamo České Budějovice (1) | Ústí nad Orlicí |
| 30 September 2020 | FC Hradec Králové (2) | 2–1 | 1. FK Příbram (1) | Hradec Králové |
| Stadium: Všesportovní stadion |
| postponed | SK Slavia Prague (1) | 0–0 (a.e.t.) (5–1 p) | FK Dukla Prague (2) | Prague |
| Stadium: Sinobo Stadium |
| postponed | FK Přepeře (3) | 1–0 | FC Viktoria Plzeň (1) | Přepeře |
| postponed | FK Viktoria Žižkov (2) | 0–0 (a.e.t.) (2–4 p) | FC Slovan Liberec (1) | Prague |
Fourth round
edit| 2021 | SK Slavia Prague (1) | 3–0 | FC Zbrojovka Brno (1) | Prague |
| Stadium: Sinobo Stadium |
| 2021 | AC Sparta Prague (1) | 1–2 | FK Mladá Boleslav (1) | Prague |
| Stadium: Strahov Stadium |
| 2021 | FC Slovan Liberec (1) | 5–0 | TJ Jiskra Domažlice (3) | Liberec |
| Stadium: Stadion u Nisy |
| 2021 | Bohemians 1905 (1) | 1–2 | FK Teplice (1) | Prague |
| Stadium: Ďolíček |
| 2021 | 1. FC Slovácko (1) | 1–0 (a.e.t.) | SFC Opava (1) | Uherské Hradiště |
| Stadium: Městský fotbalový stadion Miroslava Valenty |
| 2021 | FK Přepeře (3) | 4–2 | SK Líšeň (2) | Přepeře |
| 2021 | FC Sellier & Bellot Vlašim (2) | 1–0 | SK Dynamo České Budějovice (1) | Vlašim |
| Stadium: Stadion Kollárova ulice |
| 2021 | FC Hradec Králové (2) | 0–0 (a.e.t.) (0–5 p) | FC Baník Ostrava (1) | Hradec Králové |
| Stadium: Všesportovní stadion |
Quarter-finals
edit| 2021 | FC Sellier & Bellot Vlašim (2) | 0–0 (a.e.t.) (5–4 p) | 1. FC Slovácko (1) | Vlašim |
| Stadium: Stadion Kollárova ulice |
| 2021 | FK Teplice (1) | 1–0 | FK Přepeře (3) | Teplice |
| Stadium: Na Stínadlech |
| 2021 | FK Mladá Boleslav (1) | 0–2 | FC Slovan Liberec (1) | Mladá Boleslav |
| Stadium: Lokotrans Aréna |
| 2021 | SK Slavia Prague (1) | 1–0 | FC Baník Ostrava (1) | Prague |
| Stadium: Sinobo Stadium |
Semi-finals
edit| 2021 | FK Teplice (1) | 0–3 | SK Slavia Prague (1) | Teplice |
| Stadium: Na Stínadlech |
| 2021 | FC Slovan Liberec (1) | 1–2 | FC Sellier & Bellot Vlašim (2) | Liberec |
| Stadium: Stadion u Nisy |
Final
edit| SK Slavia Prague (1) | 0–0 (a.e.t.) | FC Sellier & Bellot Vlašim (2) |
|---|---|---|
| Penalties | ||
| 0–2 | ||