User:Kaden.Rawson/sandbox

This sandbox will be used for the following purposes:

Facilitate collaboration pertaining to the addition of "Kinesin regulation" to the article "Kinesin" for UofU Molecular Motors Spring 2019

Materials to read and gather information from:

Auto inhibition:

- Dr. Vershinin recommends working on auto inhibition because it is the least disputed means of regulation.

***"The Structure of the Kinesin-1 Motor-Tail Complex Reveals the Mechanism of Autoinhibition" Hung Yi Kristal Kaan, David D. Hackney, Frank Kozielski

Cell, Volume 56, Issue 5, 867-878 (1989)

J Biol Chem, vol. 274, no. 21, 14617–14623 (1999)

Nature Reviews Molecular Cell Biology 1, 50-58 (2000)

***Nature Reviews Molecular Cell Biology 10, 765-777 (2009)

J Cell Biol. 176(1): 11–17 (2007)

Auto-Inhibition GIF

Spacial depiction of mobile and self-inhibited conformations. Mobile conformation: The IAK region in the coiled-coil tail (green) are not present and therefore kinesin-1 motor domains (yellow and orange) are not bound and can move freely along the microtubule (MT). Self-inhibited conformation: IAK region of the tail (green) binds to motor domains (yellow and orange) to inhibit the enzymatic cycle of kinesin-1 and prevent binding to MT.PDB 2Y65; PDB 2Y5W.

Изображение передвижной формы и само-ингибирования. Передвижная форма: двигательные домены кинезина-1 (желтый и оранжевый) могут свободно двигаться вдоль микротрубочки при отсутствии области IAK тяжелой цепи в спиральной катушке хвостового домена (зеленый). Само-ингибирование: IAK область хвоствого домена (зеленый) образовывает связь к двигательным доменам (желтый и оранжевый), чтобы препятствовать ферментативному циклу для передвижения и формированию крепительных связей к микротрубочкам.

Depiction of one of two possible self-inhibition conformations of kinesin-1. The positively charged residues (blue) of the IAK region of the coiled-coil tail peptide (green) interact at multiple locations with negatively charged residues (red) of the kinesin-1 motor domains (yellow and orange) to inhibit the enzymatic cycle of kinesin-1, forcing the molecular motor to maintain a closed conformation which prevents binding to the microtubule.PDB 2Y65.

Изображение одного из двух возможных само-ингибирований. Положительно заряженные аминокислотные остатки в области IAK (синие) тяжелой цепи в спиральной катушке хвостового домена (зеленый) находятся между моторными доменами кинезина-1 и образовывают связь в нескольких местах с отрицательно заряженными аминокислотными остатками (красные) на обоих двигательных доменах, чтобы IAK область хвостового домена кинезина-1 препятствовала ферментативному циклу по передвижению и крепительной связи к микротрубочкам. PDB 2Y65.

Изображение передвижной формы и само-ингибирования. Передвижная форма: двигательные домены кинезина-1 (желтый и оранжевый) могут свободно двигаться вдоль микротрубочки при отсутствии области IAK тяжелой цепи в спиральной катушке хвостового домена (зеленый). Само-ингибирование: IAK область хвоствого домена (зеленый) образовывает связь к двигательным доменам (желтый и оранжевый), чтобы препятствовать ферментативному циклу для передвижения и формированию крепительных связей к микротрубочкам. PDB 2Y65; PDB 2Y5W.

Facilitate creation of "Kinesin binding to microtubules" to the article "Kinesin" for UofU Molecular Motors Spring 2019

Animation of Kinesin bound to microtubule.

Facilitate translation of "Kinesin regulation" and "Kinesin binding to microtubules" to the Russian language for the article "Кинезин"

Передвижная форма: двигательные домены кинезина-1 (желтый и оранжевый) могут свободно двигаться вдоль микротрубочки при отсутствии положительно заряженных аминокислотных остаток в области IAK (синие) тяжелой цепи в спиральной катушке хвостового домена (зеленый).

Само-ингибирование: положительно заряженные аминокислотные остатки в области IAK (синие) тяжелой цепи в спиральной катушке хвостового домена (зеленый) находятся между моторными доменами кинезина-1 и образовывают связь в двух местах с отрицательно заряженными аминокислотными остатками (красные) на обоих двигательных доменах, чтобы IAK область хвоста кинезина-1 препятствовала ферментативному циклу по передвижению и крепительной связи к микротрубочкам.

положительно заряженные аминокислотные остатки в области IAK (синие) тяжелой цепи в спиральной катушке хвостового домена (зеленый) отсутствуют и поэтому двигательные домены кинезина-1 (желтый и оранжевый) могут свободно двигаться вдоль микротрубочки.