Wayne Black and Kevin Ullyett were the defending champions, but Black retired in 2006, and only Ullyett competed that year.
Ullyett partnered with Paul Hanley, but Bob Bryan and Mike Bryan defeated them 6–3, 7–5, in the final.
| Doubles | |
|---|---|
| 2006 Rogers Masters | |
| Champions |  Bob Bryan Mike Bryan |
| Runners-up |  Paul Hanley Kevin Ullyett |
| Score | 6–3, 7–5 |
Seeds
editAll seeds receive a bye into the second round.
Bob Bryan / Mike Bryan (champions)
Jonas Björkman / 
Max Mirnyi (quarterfinals)
Paul Hanley / 
Kevin Ullyett (final)
Mark Knowles / 
Daniel Nestor (semifinals)
Fabrice Santoro / 
Nenad Zimonjić (quarterfinals)
Jonathan Erlich / Andy Ram (second round)
Martin Damm / 
Leander Paes (semifinals)- Lukáš Dlouhý / Pavel Vízner (second round)
Draw
editKey
edit- Q = Qualifier
- WC = Wild card
- LL = Lucky loser
- Alt = Alternate
- SE = Special exempt
- PR = Protected ranking
- ITF = ITF entry
- JE = Junior exempt
- w/o = Walkover
- r = Retired
- d = Defaulted
- SR = Special ranking
Finals
edit| Semifinals | Final | ||||||||||||
| 1 | Bob Bryan Mike Bryan
| 6 | 66 | [10] | |||||||||
| 4 |  Mark Knowles Daniel Nestor
| 3 | 7 | [5] | |||||||||
| 1 | Bob Bryan Mike Bryan
| 6 | 7 | ||||||||||
| 3 | Paul Hanley Kevin Ullyett
| 3 | 5 | ||||||||||
| 3 | Paul Hanley Kevin Ullyett
| 3 | 6 | [10] | |||||||||
| 7 |  Martin Damm Leander Paes
| 6 | 3 | [4] | |||||||||
Top half
edit| First round | Second round | Quarterfinals | Semifinals | ||||||||||||||||||||||||
| 1 | B Bryan M Bryan
| 6 | 6 | ||||||||||||||||||||||||
 M Fyrstenberg M Matkowski
| 3 | 4 |  F González I Ljubičić
| 2 | 4 | ||||||||||||||||||||||
| F González I Ljubičić
| 6 | 6 | 1 | B Bryan M Bryan
| 3 | 6 | [10] | ||||||||||||||||||||
| WC |  F López R Nadal
| 7 | 6 | 5 |  F Santoro N Zimonjić
| 6 | 4 | [7] | |||||||||||||||||||
| L Friedl C Suk
| 65 | 4 | WC | F López R Nadal
| 60 | 4 | |||||||||||||||||||||
| 5 | F Santoro N Zimonjić
| 7 | 6 | ||||||||||||||||||||||||
| 1 | B Bryan M Bryan
| 6 | 66 | [10] | |||||||||||||||||||||||
| 4 | M Knowles D Nestor
| 3 | 7 | [5] | |||||||||||||||||||||||
| 4 | M Knowles D Nestor
| 6 | 7 | ||||||||||||||||||||||||
 G Gaudio S Prieto
| 7 | 5 | [10] | G Gaudio S Prieto
| 3 | 62 | |||||||||||||||||||||
| ALT |  C Haggard J Thomas
| 5 | 7 | [4] | 4 | M Knowles D Nestor
| 2 | 6 | [10] | ||||||||||||||||||
| WC | P Bester F Dancevic
| 2 | 4 | 8 |  S Aspelin T Perry
| 6 | 3 | [2] | |||||||||||||||||||
| S Aspelin T Perry
| 6 | 6 | S Aspelin T Perry
| 6 | 6 | ||||||||||||||||||||||
| 8 | L Dlouhý P Vízner
| 1 | 3 | ||||||||||||||||||||||||
Bottom half
edit| First round | Second round | Quarterfinals | Semifinals | ||||||||||||||||||||||||
| 6 |  J Erlich A Ram
| 4 | 6 | [6] | |||||||||||||||||||||||
W Arthurs D Hrbatý
| 6 | 4 | [10] | W Arthurs D Hrbatý
| 6 | 3 | [10] | ||||||||||||||||||||
| J Acasuso D Nalbandian
| 1 | 6 | [1] | W Arthurs D Hrbatý
| 4 | 3 | |||||||||||||||||||||
| D Ferrer T Robredo
| 6 | 3 | [11] | 3 | P Hanley K Ullyett
| 6 | 6 | ||||||||||||||||||||
R Lindstedt J Nieminen
| 4 | 6 | [9] | D Ferrer T Robredo
| 4 | 7 | [4] | ||||||||||||||||||||
| 3 | P Hanley K Ullyett
| 6 | 5 | [10] | |||||||||||||||||||||||
| WC | P Hanley K Ullyett
| 3 | 6 | [10] | |||||||||||||||||||||||
| 7 | M Damm L Paes
| 6 | 3 | [4] | |||||||||||||||||||||||
| 7 | M Damm L Paes
| 7 | 6 | ||||||||||||||||||||||||
F Čermák J Knowle
| 4 | 0 | T Berdych J Levinský
| 5 | 1 | ||||||||||||||||||||||
| T Berdych J Levinský
| 6 | 6 | 7 | M Damm L Paes
| 7 | 7 | |||||||||||||||||||||
 M Safin D Tursunov
| 6 | 6 | 2 | J Björkman M Mirnyi
| 64 | 5 | |||||||||||||||||||||
| J Blake R Ginepri
| 4 | 4 | M Safin D Tursunov
| 4 | 2 | ||||||||||||||||||||||
| 2 | J Björkman M Mirnyi
| 6 | 6 | ||||||||||||||||||||||||